巴氏殺菌機、巴氏滅菌機、低溫巴氏設備主要應用于食品飲料等行業，名子有很多，可以延伸為低溫殺菌機、低溫殺菌設備、巴氏殺菌設備。最早是用于啤酒的殺菌領域，起源于法國釀酒業，巴斯德受人之托，為了解決啤酒的發酸的情況，當時啤酒釀出后無法飲用。最后，巴斯德的研究結果是：以50~60攝氏度的溫度加熱啤酒半小時，就可以殺死啤酒里的乳酸桿菌和芽孢，而不必煮沸。這一方法挽救了法國的釀酒業。這種滅菌法也就被稱為“巴氏滅菌法”。

現在在巴氏殺菌機主要用于奶制品和一些豆干類、腌漬菜類、米酒等產品的殺菌，根本的宗旨沒有改變，利用水溫殺死包裝內的有害菌類，使其不會在包裝好的產品內進行繁衍，進而達到滅菌的目的，溫度在高低因產品的類別而不一，巴氏殺菌的水溫并不是越高越好，有些產品如果用高溫的方法反而會造成口感和品質的變化。

軟包裝（袋裝）的產品一般會采用水浴式網帶巴氏殺菌機，只要產品可以殺透，產品可以采用堆疊的方式進行處理，不論是哪種產品，必須要殺透，否則殺菌就沒有意義。