利用氣相色譜儀分析有機污染物時，水樣采集后必須盡快送到實驗室進行測定。通常情況下，水樣運輸時間不超過24h，在運輸過程中應注意：裝箱前應將水樣容器內外蓋蓋緊，對盛水樣的玻璃磨口瓶應用聚乙烯薄膜覆蓋瓶口并用細繩將瓶塞與瓶頸系緊；裝箱時用泡沫塑料或波紋紙板隔墊和間隔以防止震動，同一采樣點的樣品瓶應盡量裝在同一箱內。

　　運輸過程中應避免日光照射，氣溫異常偏高或偏低時還應采取適當措施。對于測試有機污染樣品，應盡量避光，低溫冷藏運輸。

　　而水樣的保存方法主要有以下幾種：

　　1 冷藏與冷凍

　　冷藏與冷凍主要作用是抑制微生物活動、減緩物理作用和化學反應速率。常見的保存條件有2——5℃冷藏和-18——-22℃冷凍。

　　2 過濾與離心分離

　　水樣渾濁不僅影響分析結果，還會加速水樣的變化。如果測定溶解態組分，水樣可用0.45um的微孔濾膜過濾，除去藻類和細菌，提高水樣的穩定性。為了減少過濾吸附損失，測定有機項目時一般選用玻璃纖維或聚四氟乙烯過濾器。泥沙型水樣可用離心方法分離；含有機物多的水樣可用濾紙或砂芯漏斗進行過濾。

　　3 加入保存劑

　　加入保存劑方式主要有調節水樣pH值、加入生物抑制劑、氧化劑或還原劑等方式，主要注意的問題就是加入保存劑不能干擾以后的測定，保存劑應用優級純試劑配制，同時需要做相應的空白試驗，對測定結果進行校正。